Comodo Uninstaller – majhen pripomoček za odstranitev Comodo antivirusov. Programska oprema je uporabna v primerih, ko tradicionalne metode Windows ne morejo popolnoma odstraniti Comodo Antivirus, Comodo Internet Security ali Comodo Firewall. Comodo Uninstaller pomaga odstraniti vse ostanke varnostnih izdelkov iz sistema, vključno z vnosi v registru, datotekami, gonilniki in podatki o zagonu. Programska oprema zažene postopek skeniranja za zaznavanje datotek, povezanih z antivirusom, in odstrani vse zaznane ostanke. Po čiščenju sistema mora program Comodo Uninstaller znova zagnati računalnik, da dokonča odstranitev.